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La tecnologia del MicroArray fenotipico

Carlo Viti; Francesca Decorosi; Luciana Giovannetti

La tecnologia del MicroArray fenotipico consente di ottenere un ampio quadro sulle capacitā metaboliche di una cellula fornendo informazioni su circa 2000 caratteri fenotipici (permette di saggiare caratteri fenotipici legati al catabolismo e alla biosintesi di composti del carbonio, dell'azoto, del fosforo e dello zolfo; alla presenza di osmoliti; agli effetti degli ioni e di un vasto spettro di composti chimici quali antibiotici, antimetaboliti, inibitori della respirazione e metalli pesanti; all'influenza del pH sulla crescita). I dati conseguibili tramite la tecnologia del MicroArray fenotipo, dando informazioni a livello cellulare, integrano e completano quelle ottenute tramite analisi di tipo genomico e/o proteomico. Sebbene questo approccio sia stato utilizzato per studiare microrganismi isolati, oggi c'č una reale possibilitā di applicarlo allo studio delle comunitā microbiche dei suoli. Gli usi di questa tecnologia per la caratterizzazione fenotipica globale dei microrganismi nei campi della microbiologia di base e applicata sono descritti e discussi.

abstract

Phenotype MicroArray technology gives a comprehensive scan of the physiology of the cell, testing about 2000 phenotypic characters (the main catabolic pathways in cells for carbon, nitrogen, phosphorus and sulphur, as well as biosynthetic pathways; osmotic and ions effects on the cell; pH growth range and pH regulation; the sensitivity of the cell to a wide range of chemicals, including antibiotics, antimetabolities, toxic metals). The phenomic data obtained by Phenotype MicroArray technology is a very useful form of information that complements the current information obtained from biochemical and molecular analysis. Although this approach has been used to study isolated microorganisms, today there is a real possibility of using the technology of Phenotype MicroArray to the study of soil communities. The uses of this global phenotyping technology in basic and applied microbiology research are described.

articolo contenuto in Quaderno IX_2010

 

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